Окончил Высшее театральное училище им. М.С. Щепкина.
В МОГТЮЗе работает с 1977 года.
За 30 лет работы Сергей Ступников сыграл более 60 ролей. Играя Винни-Пуха в «Пир горой Винни-Пуха» Б.Заходера, он в это же время был Собакевичем в «Мертвых душах» Н.Гоголя и Шамраевым в «Чайке» А.П.Чехова. Играл Ямомото в «Прощай, овраг» Л.Чутко, Жениха в «Мещанской свадьбе» Б.Брехта, Сальери в «Прощай» А.С.Пушкина, Яичницу в «Женитьбе» Н.В.Гоголя, Тарталью в «Чудовище» К.Гоцци, парня из «Забавы» К.Мрожека, Флюгерио в «Волшебных кольцах» Т.Габбе и др.
Участвует в спектаклях
Дюймовочка
— Музыкальная сказка по мотивам произведения Г.Х.Андерсена
Спящая красавица
— Музыкальная сказка в стиле стимпанк для взрослых и детей по мотивам х/ф «Сказки старого волшебника»